“The Seventh Son” se lanzó originalmente en 1980 en RA Records y se convirtió en el Santo Grial del jazz. Cualquiera que coleccione Jazz Espiritual no se ha de perder esta reedición. Malachi se mudo a Chicago siendo un niño y acreditó su interés en la trompeta cuando tenía 11 años. Malachi trabajó en la escena del rhythm and blues en el lado sur de Chicago cuando era adolescente. En 1968, se unió a la Asociación para el Avance de los Músicos Creativos (AACM), y pasó algún tiempo en la big band de la AACM.
Thompson trabajó con los saxofonistas Joe Henderson, Jackie McLean, Frank Foster y Archie Shepp, entre otros músicos, mientras vivía en Nueva York. Formó su banda Freebop en 1978 y finalmente se mudó a Washington, D.C. Thompson también trabajó con la Hot Trumpets Repertory Company de Lester Bowie y formó Africa Brass, un grupo inspirado en las bandas de música tradicionales de Nueva Orleans.
Con el objetivo de preservar Sutherland Theatre en el lado sur de Chicago, Thompson fundó Sutherland Community Arts Initiative, una corporación sin fines de lucro, en 1991. También escribió música incidental para una obra de teatro.
Informado en 1989 que sufría de linfoma de células T y le quedaba un año de vida, Thompson afirmó que fue curado por radiación y leyendo sobre jazz. Murió en Chicago, Illinois de una recaída de su cáncer en 2006.